净化工程的关键是设计，工程设计水平的好坏直接关系到整个工程的施工，也将影响净化工程今后的稳定性、可靠性和经济性。
1.工艺流程和建筑平面的合理布局
流程安排尽可能短，减少交叉往返，人流和物流合理。在保证基本要求的前提下，要配备人员净室、物料净室，除了房间的产品工艺要求外，还要配备卫浴室、洗衣房、临时储藏室等，净化项目的面积应与生产规模相一致，保证基本要求。
2.选择符合净化车间特点的建筑结构和材料。
在净化工程设计中，一般采用50 mm厚的夹层彩色钢板，其外观美观，刚性强。弧形墙角、门、窗框等一般采用特殊的氧化铝型材。地面可采用环氧自流平地板耐磨塑料地板，有抗静电要求，选用防静电型。回风管一般采用镀锌钢板，不宜选用玻璃棉保温材料。净化车间应选用专用灯具和灯管照明。
3.对空调净化排风系统进行划分和布置，选择合理的空气净化通风设备。
净化系统组织设计的原则是，相邻二次滤池的效率不能太近，也不能太差，也可以分为四个层次，排气系统有一般排气系统、有机废气排放系统、酸性气体排放系统、碱性气体排放系统等。在设计净化车间时，应根据实际情况选择。
4.在设计净化项目时，无论是新建的净化车间还是改建的净化车间，都必须按照有关国家标准和规格进行。
净化工程技术的兴起只是上个世纪的事，但在今天净化技术发挥的重要作用是显而易见的。随着产品向高、细、尖方向的发展，对净化车间的依赖程度越来越高；随着净化技术的发展，建筑净化车间的技术含量越来越高，非专业人员也不能。除生产领域外，净化工程技术将逐渐应用于家庭、公共场所，为人们提供更清洁的生活空间。
