无尘车间设计中的气流组织与普通空调房间不同。后者要求洁净的空气首先输送到作业现场，其作用是限制和减少加工材料的污染。因此，在气流组织设计中应考虑以下原则：尽可能减少涡流，避免工作区外的污染，尽可能防止粉尘再次飞扬，从而减少粉尘污染的可能性，使工作区内的气流和风速尽可能统一尽可能的，以满足工艺和卫生要求，并使空气中的粉尘在气流到回风口时能被有效地带走。根据不同的清洗要求，选择不同的输送和回风。
不同的气流组织，每个组织都有自己的特点和范围：
1）垂直单向流：可以获得均匀的下行气流，简单的工艺设备布局，自净能力，可以简化个人净化设施等公共设施的共同优势。四种送风方式及各自的优缺点：全布式高效滤芯具有阻力低、滤芯更换周期长的优点，但屋顶结构复杂，成本高。全孔板顶送与全布高效滤顶送料的优缺点相反。全孔板顶出在系统中处于不连续运行状态，孔板表面易起尘，维护性差，对清洁度有一定影响；由于需要混合层，密相扩散顶出仅适用于4米及以上的洁净室，其特点与全孔板顶送相似，侧墙底部均匀布置的回风方式仅适用于两侧净距小于6米的洁净室，仅适用于一侧墙下墙间距较小（如2～3m）的洁净室。
2） 水平单向流：仅在第一个工作区达到100级清洁度。当空气流向另一端时，粉尘浓度逐渐增大，因此只能选择同一工艺不同清洗要求的洁净室；
3） 气流错乱：板顶输送和密集扩散器的特点同上：侧输的优点是管道布置方便，无技术夹层，成本低，有利于老厂改造。缺点是工作区风速大，风侧粉尘浓度高于风侧；但多个通风口的均匀布置或采用高效扩散器，也会使工作区内的气流更加均匀，但在不连续运行的情况下系统中，扩散板容易产生积灰。
